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Natureフォーカス:m6Aレプリメントは分離を促進する

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2019年8月23日

m6AはmRNAの中で最も一般的なヌクレオチ修復で、2代目順番を測定した結果k約1/4のmRNAが少なくとも1つのm6Aが位相を修復することを含むことを表します。RRACHのmotifで発生するm6Aの修飾は、mRNAのモーションスタート場所の豊度が高い【1、2】。m6Aレコーディングは、mRNA代謝の様々なプロセスに関与し、書き起こしの後のスクラップ、翻訳効率、mRNA安定性などの調節【3−6】を含むがこれらに限定されない。近年の研究によると、m6Aは多種の細胞生物学過程に影響を与えることができ、免疫などの面で重要な役割を果たしている【七、8】。m6Aの精密コントロールメカニズムおよびその生物学的機能はRNA分野の研究のホットな話題になっている。

 

細胞生物学プロセスへの影響については長年研究されてきたが、m6A修飾がどのようにこれらの基本的な生物学的プロセスに影響を与え、異なる細胞環境の下でどのように異なる機能を発揮するかについての問題はまだ解決されていない。

 

2019年7月11日、Cornell UniversityからSamite R. Jaffrey instituted班は、m6A enhances the phase separation potential of mRNAと題する論文をNatureに発表し、mRNAとYTHDFタンパク質の分離を促進し、一連の細胞生物学的プロセスに影響を与えていると報じた。

 

細胞生物学

 

また、庄小威実験室もほぼ同時に、bidi上でm6A-binding YTHDF proteins promote stress granule formation by modulating phase separation of stress granule proteinsと投稿している。

 

mRNA

 

Samite R. Jaffrey実験室は長い間、mRNAの転写と飾り付けの調節に力を入れ、Natureなどに高いレベルの文章を発表した。また、RNAメチル化(m6A) 免疫共沈淀量測定法(mariposa)技術を作成し、全書き起こしグループ内でメチル化のRNA領域を研究することができる。著者はこの文章の中で、古典的なm6A結合タンパク: YTHDF1 (DF1) 、YTHDF2 (DF2) およびYTHDF3 (DF3) を研究対象として、mRNA安定性とその翻訳効率の調節メカニズムを明らかにしようとする。

 

DF1, DF2, DF3の1段目のシーケンス解析によると、3つのタンパク質は、構造的に高度に保守的であり、m6Aと結合するYTH構造領域のサイズであり、約40kDaの順序領域である区域(Low complexity domain)構成を含む。このような構造を基に、著者はこれら3つのタンパク質が、liquid-liquid phase separation (LLPS)現象が起こりうると推定する。それで著者は、細胞内で一番たくさん入っているDFタンパク質のうち、DF2タンパク質を純化する。著者はさらに、4度の低温の下で、DF2タンパク質溶液が透明になって、温度が37まで上がると、その溶液が濁ってしまったことを発見した。再び4度まで下がった後、溶液は澄ました状態に戻る。著者はさらに別の方法を使って、DF2の現象がLLPSであることを確認した。また、生理的濃度でのDF2タンパク質(約5uM)の分離現象も明らかになった。

 

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