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ノックアウトを希望する遺伝子名を教えていただくと、研究ニーズを満たすヌクレアーゼ媒介ストラテジーを設計します。標的上のヌクレアーゼ活性を最大にし、標的外の影響を最小化する最適なアルゴリズムとヌクレアーゼ発現ベクターを設計します。成功率を高めるため、各遺伝子につき少なくとも2つの標的部位に対するベクターを設計します。ファウンダースクリーニングのため、PCRおよびシークエンシングに基づくジェノタイピングも行います。
ご希望のヌクレアーゼを発現するDNAベクターを構築します。 必要に応じて、これらのベクターの有効性を細胞培養においてテストします。
- ヌクレアーゼmRNAの調整:ヌクレアーゼ発現ベクターをin vitroで転写します。獲得したmRNAは人工的にポリアデニル化され、哺乳動物細胞に置けるタンパク質へ適切に転写されます。
- ファウンダー獲得のためのヌクレアーゼインジェクション:ヌクレアーゼmRNAを受精したラット卵にインジェクションし、代理母に移植して子孫を獲得します。ヌクレアーゼ発現ベクターを当社で設計および構築する場合、保証を満たすのに十分な数のインジェクションを行います。ヌクレアーゼ発現ベクター(またはmRNA産物)をお客様からご提供いただく場合、ご希望の突然変異をもつファウンダー獲得のために少なくとも200~300個の受精卵(株に基づく)にインジェクションし、スクリーニングを行います。ファウンダーが特定されていない場合は、追加料金でより多くのインジェクションを行うことができます。
PCRおよびシークエンシングで、ファウンダーラットのスクリーニングをします。具体的には、ヌクレアーゼによって標的化される部位のPCRを増幅し、続いて突然変異を明らかにするためにPCRの配列決定を行います。少なくとも1本鎖においてフレームシフト欠失/挿入または重要なエキソン欠失を有するラットは、ノックアウトファウンダーと考えられます。また、標的部位の2本鎖ともノックアウトされる場合もございます。
いくつかのプロジェクトでは、ファウンダーのノックアウトラットが成果物になります。しかし、F1ラットを獲得するためにファウンダーをさらに繁殖をご希望される方もいらっしゃいます。そこで、一致する系統の野生型ラットに3匹のファウンダーを繁殖させ、ノックアウト対立遺伝子を有するF1ラットを獲得することができます。