Xrn1-flox Mouse
一般名
Xrn1-flox
製品ID
S-CKO-08352
背景情報
C57BL/6JCya
系統ID
CKOCMP-24127-Xrn1-B6J-VA
状況
このマウス系統を論文で使用する場合は、「Xrn1-flox Mouse(カタログ番号S-CKO-08352)はサイアジェンから購入しました。」と引用してください。
製品タイプ
年齢
遺伝子型
性別
数量
標準的な配送方法では、少なくとも3匹のヘテロ接合体キャリアを保証しています。ホモ接合体キャリアや指定された性別の個体の繁殖サービスも利用可能です。
基本情報
系統名
Xrn1-flox
系統ID
CKOCMP-24127-Xrn1-B6J-VA
遺伝子名
製品ID
S-CKO-08352
遺伝子別名
exo, Dhm2, mXrn1
遺伝子別名
C57BL/6JCya
NCBI ID
修正
Conditional knockout
染色体
Chr 9
表現型
アプリケーション
--
さらに
系統詳細
EnsemblトランスクリプトID
ENSMUST00000034981
NCBIトランスクリプトID
NM_011916
ターゲット領域
Exon 2
有効領域の大きさ
~0.7 kb
遺伝子研究の概要
Xrn1, an exoribonuclease, plays a crucial role in RNA decay, executing the last step of mRNA degradation in the cytoplasm along the 5'-3' direction [3,4,5,9]. It is involved in multiple pathways such as dsRNA sensing, mRNA decapping and decay, and is associated with important biological processes like reproduction, metabolism, and immune response [1,2,3,5,6,7,8]. Genetic models, especially knockout models, are valuable for studying its functions.
In interferon-activated cancer cells, Xrn1 deletion causes PKR-dependent cell lethality, highlighting its role as a negative regulator of the PKR pathway [1,2]. In Macrobrachium nipponense, knockdown of Mn-XRN1 accelerates ovarian development, indicating its inhibitory effect on ovarian reproduction [5]. In forebrain-specific Xrn1 conditional knockout (Xrn1-cKO) mice, obesity, leptin resistance, hyperglycemia, hyperphagia, and decreased energy expenditure occur, suggesting that XRN1 in the hypothalamus is critical for metabolic homeostasis [8]. Targeting XRN1 in cancer cells can also potentiate the efficacy of cancer immunotherapy as its depletion activates IFN signaling and the viral defense pathway [7].
In conclusion, Xrn1 is essential for RNA decay and is involved in diverse biological processes. Gene knockout and conditional knockout mouse models have revealed its significance in cancer, reproduction, and metabolic diseases. These findings offer potential therapeutic targets for related diseases and enhance our understanding of the underlying molecular mechanisms.
References:
1. Zou, Tao, Zhou, Meng, Gupta, Akansha, Cherniack, Andrew D, Meyerson, Matthew. 2024. XRN1 deletion induces PKR-dependent cell lethality in interferon-activated cancer cells. In Cell reports, 43, 113600. doi:10.1016/j.celrep.2023.113600. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38261514/
2. Zou, Tao, Zhou, Meng, Gupta, Akansha, Cherniack, Andrew D, Meyerson, Matthew. 2023. XRN1 deletion induces PKR-dependent cell lethality in interferon-activated cancer cells. In bioRxiv : the preprint server for biology, , . doi:10.1101/2023.08.01.551488. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37577567/
3. Brothers, William R, Ali, Farah, Kajjo, Sam, Fabian, Marc R. 2023. The EDC4-XRN1 interaction controls P-body dynamics to link mRNA decapping with decay. In The EMBO journal, 42, e113933. doi:10.15252/embj.2023113933. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37621215/
4. Sharma, Sunny, Yang, Jun, Grudzien-Nogalska, Ewa, Kwan, Kelvin Y, Kiledjian, Megerditch. 2022. Xrn1 is a deNADding enzyme modulating mitochondrial NAD-capped RNA. In Nature communications, 13, 889. doi:10.1038/s41467-022-28555-7. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35173156/
5. Chen, Tianyong, Yuan, Huwei, Qiao, Hui, Fu, Hongtuo, Jin, Shubo. 2023. Mn-XRN1 Has an Inhibitory Effect on Ovarian Reproduction in Macrobrachium nipponense. In Genes, 14, . doi:10.3390/genes14071454. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37510358/
6. Hosseini, Amir, Lindholm, Håvard T, Chen, Raymond, Greenbaum, Benjamin, De Carvalho, Daniel D. 2024. Retroelement decay by the exonuclease XRN1 is a viral mimicry dependency in cancer. In Cell reports, 43, 113684. doi:10.1016/j.celrep.2024.113684. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38261511/
7. Ran, Xue-Bin, Ding, Ling-Wen, Sun, Qiao-Yang, Jha, Sudhakar, Koeffler, H Phillip. . Targeting RNA Exonuclease XRN1 Potentiates Efficacy of Cancer Immunotherapy. In Cancer research, 83, 922-938. doi:10.1158/0008-5472.CAN-21-3052. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36638333/
8. Takaoka, Shohei, Yanagiya, Akiko, Mohamed, Haytham Mohamed Aly, Stoney, Patrick, Yamamoto, Tadashi. 2021. Neuronal XRN1 is required for maintenance of whole-body metabolic homeostasis. In iScience, 24, 103151. doi:10.1016/j.isci.2021.103151. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34646989/
9. Grousl, Tomas, Vomastek, Tomas. . Xrn1 Exoribonuclease-An Intrinsic Marker of Yeast Population Growth. In Frontiers in bioscience (Elite edition), 16, 1. doi:10.31083/j.fbe1601001. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38538525/
品質管理基準
精子検査
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凍結後の精子では、各バッチから1本の凍結保存された精子を選び出し、体外受精に使用します。
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