Pbrm1-flox Mouse
一般名
Pbrm1-flox
製品ID
S-CKO-13389
背景情報
C57BL/6JCya
系統ID
CKOCMP-66923-Pbrm1-B6J-VA
状況
このマウス系統を論文で使用する場合は、「Pbrm1-flox Mouse(カタログ番号S-CKO-13389)はサイアジェンから購入しました。」と引用してください。
製品タイプ
年齢
遺伝子型
性別
数量
標準的な配送方法では、少なくとも3匹のヘテロ接合体キャリアを保証しています。ホモ接合体キャリアや指定された性別の個体の繁殖サービスも利用可能です。
基本情報
系統名
Pbrm1-flox
系統ID
CKOCMP-66923-Pbrm1-B6J-VA
遺伝子名
製品ID
S-CKO-13389
遺伝子別名
Pb1, BAF180, 2610016F04Rik
遺伝子別名
C57BL/6JCya
NCBI ID
修正
Conditional knockout
染色体
Chr 14
表現型
アプリケーション
--
さらに
系統詳細
EnsemblトランスクリプトID
ENSMUST00000112098
NCBIトランスクリプトID
NM_001081251
ターゲット領域
Exon 5
有効領域の大きさ
~0.6 kb
遺伝子研究の概要
Pbrm1, encoding polybromo-1, is a subunit of the PBAF chromatin remodeling complex. It plays crucial roles in chromatin modification and remodeling, which are essential for regulating gene expression, maintaining genomic stability, and influencing multiple biological processes and disease-related pathways [1,3,4,7,8]. It is associated with pathways like NF-κB, and its functions are vital in normal development and disease prevention. Genetic models, such as KO/CKO mouse models, are valuable for studying its functions.
In mouse models, conditional ablation of Pbrm1 in uterine stromal cells disrupts progesterone pathways and uterine receptivity, preventing embryo implantation as it compromises Hand2 transcription and stromal-epithelial crosstalk [2]. In clear cell renal cell carcinoma (ccRCC), Pbrm1 deficiency leads to ectopic PBAF complexes, activating the pro-tumorigenic NF-κB pathway [3]. Also, Pbrm1-deficient cancers show synthetic lethality with PARP and ATR inhibitors due to elevated replication stress and R-loops [4]. In ccRCC, Pbrm1 mutations are associated with increased hERV expression in a HIF-dependent manner [5]. And Pbrm1-deficient renal cancer cells are sensitive to DNMT inhibitor 5-Fluoro-2'-Deoxycytidine [6].
In conclusion, Pbrm1 is essential for chromatin-related functions, influencing processes like embryo implantation and playing a significant role in diseases, especially ccRCC. Mouse KO/CKO models have been instrumental in revealing its functions in these specific biological and disease contexts, providing insights into potential therapeutic strategies for related diseases.
References:
1. Walton, Joseph, Lawson, Keith, Prinos, Panagiotis, Arrowsmith, Cheryl, Ailles, Laurie. 2022. PBRM1, SETD2 and BAP1 - the trinity of 3p in clear cell renal cell carcinoma. In Nature reviews. Urology, 20, 96-115. doi:10.1038/s41585-022-00659-1. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36253570/
2. Xin, Qiliang, Feng, Iris, Yu, Guoyun, Dean, Jurrien. 2024. Stromal Pbrm1 mediates chromatin remodeling necessary for embryo implantation in the mouse uterus. In The Journal of clinical investigation, 134, . doi:10.1172/JCI174194. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38426493/
3. Yao, Xiaosai, Hong, Jing Han, Nargund, Amrita M, Tan, Patrick, Teh, Bin Tean. 2023. PBRM1-deficient PBAF complexes target aberrant genomic loci to activate the NF-κB pathway in clear cell renal cell carcinoma. In Nature cell biology, 25, 765-777. doi:10.1038/s41556-023-01122-y. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37095322/
4. Chabanon, Roman M, Morel, Daphné, Eychenne, Thomas, Lord, Christopher J, Postel-Vinay, Sophie. . PBRM1 Deficiency Confers Synthetic Lethality to DNA Repair Inhibitors in Cancer. In Cancer research, 81, 2888-2902. doi:10.1158/0008-5472.CAN-21-0628. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33888468/
5. Zhou, Mi, Leung, Janet Y, Gessner, Kathryn H, Davis, Ian J, Kim, William Y. . PBRM1 Inactivation Promotes Upregulation of Human Endogenous Retroviruses in a HIF-Dependent Manner. In Cancer immunology research, 10, 285-290. doi:10.1158/2326-6066.CIR-21-0480. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35013001/
6. Gu, Di, Dong, Kai, Jiang, Aimin, Yang, Chenghua, Wang, Linhui. 2022. PBRM1 Deficiency Sensitizes Renal Cancer Cells to DNMT Inhibitor 5-Fluoro-2'-Deoxycytidine. In Frontiers in oncology, 12, 870229. doi:10.3389/fonc.2022.870229. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35719970/
7. De Silva, Saumya M, Dhiman, Alisha, Sood, Surbhi, Dykhuizen, Emily C, Musselman, Catherine A. . PBRM1 bromodomains associate with RNA to facilitate chromatin association. In Nucleic acids research, 51, 3631-3649. doi:10.1093/nar/gkad072. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36808431/
8. Zimmer, Kai, Kocher, Florian, Untergasser, Gerold, Widmann, Gerlig, Seeber, Andreas. 2023. PBRM1 mutations might render a subtype of biliary tract cancers sensitive to drugs targeting the DNA damage repair system. In NPJ precision oncology, 7, 64. doi:10.1038/s41698-023-00409-5. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37400502/
品質管理基準
精子検査
凍結前の精子濃度を測定し、精子の生存能力の判定します。
凍結後の精子では、各バッチから1本の凍結保存された精子を選び出し、体外受精に使用します。
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