Liat1-flox Mouse
一般名
Liat1-flox
製品ID
S-CKO-15925
背景情報
C57BL/6JCya
系統ID
CKOCMP-74230-Liat1-B6J-VA
状況
このマウス系統を論文で使用する場合は、「Liat1-flox Mouse(カタログ番号S-CKO-15925)はサイアジェンから購入しました。」と引用してください。
製品タイプ
年齢
遺伝子型
性別
数量
標準的な配送方法では、少なくとも3匹のヘテロ接合体キャリアを保証しています。ホモ接合体キャリアや指定された性別の個体の繁殖サービスも利用可能です。
基本情報
系統名
Liat1-flox
系統ID
CKOCMP-74230-Liat1-B6J-VA
遺伝子名
製品ID
S-CKO-15925
遺伝子別名
1700016K19Rik
遺伝子別名
C57BL/6JCya
NCBI ID
修正
Conditional knockout
染色体
Chr 11
表現型
アプリケーション
--
さらに
系統詳細
EnsemblトランスクリプトID
ENSMUST00000066408
NCBIトランスクリプトID
NM_198637
ターゲット領域
Exon 2
有効領域の大きさ
~1.4 kb
遺伝子研究の概要
Liat1, short for Ligand of Ate1, is a protein initially discovered through its interaction with arginyl-tRNA protein transferase 1 (Ate1), a component of the Arg/N-degron pathway of protein degradation. It stimulates the in vitro N-terminal arginylation of a model substrate by Ate1 and has a higher affinity for certain Ate1 isoforms [1]. Vertebrate and some invertebrate genomes encode Liat1-like proteins. In primates, Liat1 genes are subtelomeric, and Liat1 proteins in some primates have tandem repeats of a 10-residue sequence, which may contribute to primate evolution [1].
Mouse Liat1's N-terminal half has an intrinsically disordered region (IDR) facilitating liquid-liquid phase separation (LLPS) in the nucleolus. A poly-K region within this IDR targets Liat1 to the nucleolus, and Jmjd6 modifies Liat1, inhibiting its nucleolar targeting [2]. Also, human tRNAArg can bind recombinant mouse LIAT1, suggesting LIAT1 is an RNA-binding protein, which may be related to TDP-43 proteostasis and associated diseases [3].
In conclusion, Liat1 is involved in protein degradation pathways via its interaction with Ate1, participates in nucleolar LLPS, and has the potential to bind RNA. Studies on Liat1, especially those using mouse models, contribute to understanding its role in protein and RNA metabolism, as well as its possible implications in neurodegenerative and myodegenerative diseases related to TDP-43 malfunctions [1,2,3].
References:
1. Brower, Christopher S, Rosen, Connor E, Jones, Richard H, Piatkov, Konstantin I, Varshavsky, Alexander. 2014. Liat1, an arginyltransferase-binding protein whose evolution among primates involved changes in the numbers of its 10-residue repeats. In Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 111, E4936-45. doi:10.1073/pnas.1419587111. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25369936/
2. Arva, Akshaya, Kasu, Yasar Arfat T, Duncan, Jennifer, Alkhatatbeh, Mosleh A, Brower, Christopher S. 2020. The Ligand of Ate1 is intrinsically disordered and participates in nucleolar phase separation regulated by Jumonji Domain Containing 6. In Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 118, . doi:10.1073/pnas.2015887118. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33443146/
3. Sjekloća, Ljiljana, Buratti, Emanuele. 2024. tRNA Arg binds in vitro TDP-43 RNA recognition motifs and ligand of Ate1 protein LIAT1. In microPublication biology, 2024, . doi:10.17912/micropub.biology.001224. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39081859/
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