Trmo-flox Mouse
一般名
Trmo-flox
製品ID
S-CKO-16103
背景情報
C57BL/6JCya
系統ID
CKOCMP-74753-Trmo-B6J-VA
状況
このマウス系統を論文で使用する場合は、「Trmo-flox Mouse（カタログ番号S-CKO-16103）はサイアジェンから購入しました。」と引用してください。
製品タイプ
年齢
遺伝子型
性別
数量
標準的な配送方法では、少なくとも3匹のヘテロ接合体キャリアを保証しています。ホモ接合体キャリアや指定された性別の個体の繁殖サービスも利用可能です。
基本情報
系統名
Trmo-flox
系統ID
CKOCMP-74753-Trmo-B6J-VA
遺伝子名
製品ID
S-CKO-16103
遺伝子別名
5830415F09Rik, Nap1
遺伝子別名
C57BL/6JCya
遺伝子正式名称
tRNA methyltransferase O
NCBI ID
修正
Conditional knockout
染色体
Chr 4
表現型
アプリケーション
--
さらに
系統詳細
EnsemblトランスクリプトID
ENSMUST00000086563
NCBIトランスクリプトID
NM_029086
ターゲット領域
Exon 2
有効領域の大きさ
~0.9 kb
遺伝子研究の概要
Trmo, also known as yaeB in Escherichia coli, is a tRNA methyltransferase. It belongs to the Class VIII of AdoMet-dependent methyltransferases and is responsible for the N6-methylation of N6-threonylcarbamoyladenosine (m6t6A) in tRNAs [2]. This modification is crucial for efficient decoding of ACY codons in tRNA(Thr), ensuring proper translation. It may also be involved in broader metabolic and signal-transduction-related pathways as it was identified among genes associated with differentiated thyroid carcinoma (DTC) [1].
In E. coli, deletion of the trmO gene led to the conversion of m6t6A to cyclic t(6)A (ct(6)A), indicating that t(6)A is a common precursor for both m6t6A and ct(6)A. Also, N6-methylation of t(6)A by TrmO enhanced the attenuation activity of the thr operon, suggesting its role in efficient decoding [2]. In silico studies on a hypothetical protein from Pasteurella multocida with a tRNA (adenine (37)-N6)-methyltransferase TrmO functional domain showed its interaction with SAM and SAH, crucial metabolites in tRNA methylation, providing evidence for its possible role as an SAM-dependent MTase [3].
In conclusion, Trmo is an important tRNA methyltransferase for proper tRNA modification and translation efficiency. Its identification in DTC-associated gene loci implies a potential role in this disease. Studies on Trmo in bacteria and in silico models contribute to understanding its biological functions and its possible implications in human diseases like DTC.
References：
1. Kulkarni, Om, Sugier, Pierre-Emmanuel, Guibon, Julie, Truong, Thérèse, Lesueur, Fabienne. 2021. Gene network and biological pathways associated with susceptibility to differentiated thyroid carcinoma. In Scientific reports, 11, 8932. doi:10.1038/s41598-021-88253-0. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33903625/
2. Kimura, Satoshi, Miyauchi, Kenjyo, Ikeuchi, Yoshiho, Crécy-Lagard, Valérie de, Suzuki, Tsutomu. 2014. Discovery of the β-barrel-type RNA methyltransferase responsible for N6-methylation of N6-threonylcarbamoyladenosine in tRNAs. In Nucleic acids research, 42, 9350-65. doi:10.1093/nar/gku618. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25063302/
3. Masum, Md Habib Ullah, Rajia, Sultana, Bristi, Uditi Paul, Rahaman, Md Mizanur, Saha, Otun. 2023. In Silico Functional Characterization of a Hypothetical Protein From Pasteurella Multocida Reveals a Novel S-Adenosylmethionine-Dependent Methyltransferase Activity. In Bioinformatics and biology insights, 17, 11779322231184024. doi:10.1177/11779322231184024. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37424709/
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