Dffb-KO Mouse
一般名
Dffb-KO
製品ID
S-KO-16076
背景情報
C57BL/6JCya
系統ID
KOCMP-13368-Dffb-B6J-VB
状況
このマウス系統を論文で使用する場合は、「Dffb-KO Mouse（カタログ番号S-KO-16076）はサイアジェンから購入しました。」と引用してください。
製品タイプ
年齢
遺伝子型
性別
数量
標準的な配送方法では、少なくとも3匹のヘテロ接合体キャリアを保証しています。ホモ接合体キャリアや指定された性別の個体の繁殖サービスも利用可能です。
基本情報
系統名
Dffb-KO
系統ID
KOCMP-13368-Dffb-B6J-VB
遺伝子名
製品ID
S-KO-16076
遺伝子別名
CAD, CPAN, 40kDa, DFF40, Didff, 5730477D02Rik
遺伝子別名
C57BL/6JCya
NCBI ID
修正
Conventional knockout
染色体
Chr 4
表現型
アプリケーション
--
さらに
系統詳細
EnsemblトランスクリプトID
ENSMUST00000030893
NCBIトランスクリプトID
NM_007859
ターゲット領域
Exon 3~7
有効領域の大きさ
~8.5 kb
遺伝子研究の概要
Dffb, also known as DNA fragmentation factor subunit beta, is involved in the process of cell-free DNA (cfDNA) fragmentation. cfDNA is a non-invasive biomarker for cancer and prenatal testing, and Dffb, along with DNASE1 and DNASE1L3, plays a role in the step-by-step fragmentation of cfDNA. It first acts intracellularly, contributing to the generation of cfDNA [1].
In Dffb-deficient mice, the proportion of long cfDNA molecules originating from transcription start sites is lower compared to wild-type mice, indicating its role in the fragmentation of long cfDNA molecules [2]. Also, deletion of Dffb in mouse models led to certain aberrations in the profile of plasma DNA jagged ends, although these effects were less significant compared to Dnase1l3 deletion regarding different sizes of DNA fragments [3].
In conclusion, Dffb is essential for the intracellular stage of cfDNA fragmentation. Studies using Dffb-deficient mouse models have provided insights into its role in cfDNA fragmentation, especially in relation to the fragmentation of long cfDNA molecules and the formation of plasma DNA jagged ends, which may have implications for understanding diseases where cfDNA is a biomarker.
References:
1. Han, Diana S C, Ni, Meng, Chan, Rebecca W Y, Chiu, Rossa W K, Lo, Y M Dennis. 2020. The Biology of Cell-free DNA Fragmentation and the Roles of DNASE1, DNASE1L3, and DFFB. In American journal of human genetics, 106, 202-214. doi:10.1016/j.ajhg.2020.01.008. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32004449/
2. Che, Huiwen, Jiang, Peiyong, Choy, L Y Lois, Chan, K C Allen, Lo, Y M Dennis. 2024. Genomic origin, fragmentomics, and transcriptional properties of long cell-free DNA molecules in human plasma. In Genome research, 34, 189-200. doi:10.1101/gr.278556.123. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38408788/
3. Ding, Spencer C, Chan, Rebecca W Y, Peng, Wenlei, Allen Chan, K C, Dennis Lo, Y M. . Jagged Ends on Multinucleosomal Cell-Free DNA Serve as a Biomarker for Nuclease Activity and Systemic Lupus Erythematosus. In Clinical chemistry, 68, 917-926. doi:10.1093/clinchem/hvac050. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35587043/
品質管理基準
精子検査
凍結前の精子濃度を測定し、精子の生存能力の判定します。
凍結後の精子では、各バッチから1本の凍結保存された精子を選び出し、体外受精に使用します。
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