Ctu1-KO Mouse
一般名
Ctu1-KO
製品ID
S-KO-17469
背景情報
C57BL/6JCya
系統ID
KOCMP-233189-Ctu1-B6J-VB
状況
このマウス系統を論文で使用する場合は、「Ctu1-KO Mouse(カタログ番号S-KO-17469)はサイアジェンから購入しました。」と引用してください。
製品タイプ
年齢
遺伝子型
性別
数量
標準的な配送方法では、少なくとも3匹のヘテロ接合体キャリアを保証しています。ホモ接合体キャリアや指定された性別の個体の繁殖サービスも利用可能です。
基本情報
系統名
Ctu1-KO
系統ID
KOCMP-233189-Ctu1-B6J-VB
遺伝子名
製品ID
S-KO-17469
遺伝子別名
Atpbd3
遺伝子別名
C57BL/6JCya
NCBI ID
修正
Conventional knockout
染色体
Chr 7
表現型
アプリケーション
--
さらに
系統詳細
EnsemblトランスクリプトID
ENSMUST00000038332
NCBIトランスクリプトID
NM_145582
ターゲット領域
Exon 3
有効領域の大きさ
~2.9 kb
遺伝子研究の概要
Ctu1, a subunit of cytosolic thiouridylase, is crucial for the 2-thiolation at the 34th wobble uridine of the anticodon loop of specific tRNAs, such as tRNAGlnUUG, tRNAGluUUC, and tRNALysUUU [2,3,5]. This modification is involved in proper mRNA decoding by the ribosome, influencing translation fidelity and playing a role in pathways related to cell cycle regulation, development, and disease [2,3].
In zebrafish, deficiency of ctu1 leads to impaired angiogenesis and embryonic development, with single-cell RNA sequencing revealing cell cycle arrest, nerve development and erythrocyte differentiation defects, and attenuation of pro-angiogenic signaling pathways [2]. In nematode and fission yeast, inactivation of the Ctu1-Ctu2 complex results in loss of tRNA thiolation, thermosensitive viability decrease, ploidy abnormalities, and aberrant development, suggesting a role in maintaining genome integrity [3]. In human melanoma cells, inhibition of CTU1, along with ELP3 or CTU2, can synergize with MAPK signalling inhibition to kill cells, indicating its importance in cancer cell survival and resistance to targeted therapy [1]. In breast cancer, up-regulation of CTU1/2 sustains metastasis by supporting the translation of oncoproteins [4]. In neuroblastoma, CTU1 is identified as a prognostic-related gene, and a prognostic risk score model including CTU1 shows predictive value for patient survival [6]. In cattle, a missense variant in CTU1 may impact direct calving difficulty [7].
In summary, Ctu1 is essential for angiogenesis, embryonic development, genome integrity, and has implications in cancer and other diseases. Studies using genetic models like zebrafish, nematode, fission yeast, and in human cell lines have revealed its role in these biological processes and disease conditions, providing insights into potential therapeutic targets and prognostic markers.
References:
1. Rapino, Francesca, Delaunay, Sylvain, Rambow, Florian, Chariot, Alain, Close, Pierre. 2018. Codon-specific translation reprogramming promotes resistance to targeted therapy. In Nature, 558, 605-609. doi:10.1038/s41586-018-0243-7. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29925953/
2. Yu, Yangziwei, Wang, Chuqiao, Wang, Yan, Du, Yibin, Zhou, Zhaoli. 2024. The conserved wobble uridine tRNA thiolase Ctu1 is required for angiogenesis and embryonic development. In PloS one, 19, e0315854. doi:10.1371/journal.pone.0315854. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39705244/
3. Dewez, Monique, Bauer, Fanélie, Dieu, Marc, Vandenhaute, Jean, Hermand, Damien. 2008. The conserved Wobble uridine tRNA thiolase Ctu1-Ctu2 is required to maintain genome integrity. In Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 105, 5459-64. doi:10.1073/pnas.0709404105. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/18391219/
4. Delaunay, Sylvain, Rapino, Francesca, Tharun, Lars, Chariot, Alain, Close, Pierre. 2016. Elp3 links tRNA modification to IRES-dependent translation of LEF1 to sustain metastasis in breast cancer. In The Journal of experimental medicine, 213, 2503-2523. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27811057/
5. Liu, Yuchen, Long, Feng, Wang, Liangliang, Söll, Dieter, Whitman, William B. 2014. The putative tRNA 2-thiouridine synthetase Ncs6 is an essential sulfur carrier in Methanococcus maripaludis. In FEBS letters, 588, 873-7. doi:10.1016/j.febslet.2014.01.065. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/24530533/
6. Yang, Jun, Zhou, Jiaying, Li, Cuili, Wang, Shaohua. 2021. Integrated analysis of the functions and prognostic values of RNA-binding proteins in neuroblastoma. In PloS one, 16, e0260876. doi:10.1371/journal.pone.0260876. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34879089/
7. Purfield, Deirdre C, Bradley, Daniel G, Evans, Ross D, Kearney, Francis J, Berry, Donagh P. 2015. Genome-wide association study for calving performance using high-density genotypes in dairy and beef cattle. In Genetics, selection, evolution : GSE, 47, 47. doi:10.1186/s12711-015-0126-4. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26065883/
品質管理基準
精子検査
凍結前の精子濃度を測定し、精子の生存能力の判定します。
凍結後の精子では、各バッチから1本の凍結保存された精子を選び出し、体外受精に使用します。
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