遺伝子ノックアウトマウスにノックアウトの作製で長さが決まる？
目次
01 ノックアウト断片のサイズに関する誤解 02 安全で効率的なノックアウト設計の原則 03 ワンストップ・マウスモデル検索プラットフォーム：MouseAtlasノックアウト断片のサイズに関する誤解
遺伝子編集に対する経験の浅い研究者は、ノックアウト断片が大きいほど良いと勘違いしているでしょうか？遺伝子ノックアウトマウスを作製する目的は、ある特定の遺伝子を排除させ、できるだけほかの遺伝子の機能を妨害しないようにすることで、目的遺伝子の機能と表現型に焦点を合わせて研究することができる。周知のように、遺伝子配列がエクソン(exon)とイントロン(intron)から構成される。エクソンが転写された後に成熟なmRNAに加工され、機能のあるDNA配列と認められる。イントロンはRNA転写後に加工過程が剪断されて、無機能のDNA配列と認められる。ただし、あるイントロンが全く無機能ではなく、当該遺伝子或いは他の遺伝子の発現調整に参加するかもしれない。コンディショナルノックアウト(cKO)を行う時、LOXPなどの外来配列はイントロン安全区域に挿入した(AIはすでにSAとSD区域を避けたと予測した)と発見したが、検出により、目的遺伝子の発現はすでに妨害された。
安全で効率的なノックアウト設計の原則
現在、イントロンに対する認知度が低い。出来るだけ他の遺伝子の機能に影響しないように、弊社はノックアウトプランを設計する原則は目的遺伝子のキーエンコーディング領域をノックアウトすることであり、目的遺伝子を排除されればいい。ノックアウト遺伝子断片が大きいほど良いわけではない。現在、標的型遺伝子編集技術を用いて、大きな断片遺伝子のノックアウトを行うのは難しくなく、サイヤジェンは既に400kb以上のノックアウト断片のマウスモデルをいくつか作製しました。このような大きな断片遺伝子ノックアウトプロジェクトは通常つながっている一つの遺伝子ファミリーの複数の遺伝子を同時にノックアウトする必要があり、あるいはノックアウトする目的遺伝子自体の断片が非常に長い。
しかし、マウスモデルの安全性と有効性に基づいて、ほとんどの項目に対して、一般的にノックアウト断片は2kb程度であることが提案します。
図1: MouseAtlasを用いたマウスモデル検索のイメージ
ワンストップ・マウスモデル検索プラットフォーム：MouseAtlas
ワンストップ・マウスモデル検索プラットフォーム：MouseAtlas
MouseAtlas（マウスアトラス）は、KOマウスからヒト化マウスまで、遺伝子や製品モデル名で検索できるプラットフォームです。生体マウスか精子凍結状態か、リアルタイムの在庫状況、検証データ、詳細な説明を直感的に確認でき、直接注文も可能です。社内の製品管理システムと連携して常に最新情報が更新されており、現在39,000種類以上のモデルマウスを収録しています。研究者の皆様にとって非常に便利なワンストップソリューションです。
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| マウス関連受託 | 作製期間 | 成果物 | 価格(税別) |
|---|---|---|---|
| KOマウス生体 | 最短2週間 | KOマウス1ペア | 63万円 |
| KOマウス生体 | 最短2週間 | KOマウス2ペア | 83万円 |
| KOマウス(凍結精子) | 最短7週間 | 3匹以上のKOマウス | 90万円 |
| KOマウス(凍結精子) | 最短7週間 | 3匹以上のKOマウス | 180万円 |
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サイヤジェン株式会社について
サイヤジェン株式会社は15年間の発展を経て、全世界の数万人の科学研究者にサービスを提供しており、製品と技術は直接にCNS (Cell、Nature、Science)の定期刊を含む5,200余りの学術論文に応用されています。弊社の「ノックアウトマウスライブラリ」は低価格だけでなく、遺伝子名称を入力すれば、ワンクリックで注文まで操作できます。 ノックアウトマウス、ノックインマウス、コンディショナルノックアウトマウス、トランスジェニックマウス、GFPマウス、免疫不全マウス、無菌マウスなどのカスタマイズサービスを提供する以外、専門的な手術疾患モデルチームがあり、多種の複雑な小動物手術疾患モデルも提供できます。
